Protein–RNA interactions for Protein: P43029

Gdf7, Growth/differentiation factor 7, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf7P43029 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gdf7P43029 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gdf7P43029 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gdf7P43029 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gdf7P43029 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gdf7P43029 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gdf7P43029 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gdf7P43029 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gdf7P43029 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gdf7P43029 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gdf7P43029 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gdf7P43029 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdf7P43029 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms