Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tac1P41539 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tac1P41539 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tac1P41539 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tac1P41539 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tac1P41539 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms