Protein–RNA interactions for Protein: P40336

Vps26a, Vacuolar protein sorting-associated protein 26A, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps26aP40336 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps26aP40336 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.7 ms