Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf2P39429 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf2P39429 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf2P39429 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf2P39429 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf2P39429 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf2P39429 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf2P39429 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf2P39429 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf2P39429 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms