Protein–RNA interactions for Protein: P33611

Pola2, DNA polymerase alpha subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola2P33611 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pola2P33611 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pola2P33611 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pola2P33611 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pola2P33611 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pola2P33611 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms