Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms