Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccnd3P30282 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccnd3P30282 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccnd3P30282 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccnd3P30282 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccnd3P30282 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccnd3P30282 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccnd3P30282 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccnd3P30282 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccnd3P30282 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccnd3P30282 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccnd3P30282 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccnd3P30282 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccnd3P30282 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccnd3P30282 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccnd3P30282 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccnd3P30282 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccnd3P30282 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms