Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

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Length 674 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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