Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms