Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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