Protein–RNA interactions for Protein: P21237

Bdnf, Brain-derived neurotrophic factor, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BdnfP21237 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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BdnfP21237 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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BdnfP21237 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BdnfP21237 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BdnfP21237 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
BdnfP21237 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
BdnfP21237 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
BdnfP21237 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
BdnfP21237 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BdnfP21237 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BdnfP21237 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BdnfP21237 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BdnfP21237 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BdnfP21237 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BdnfP21237 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BdnfP21237 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BdnfP21237 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BdnfP21237 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BdnfP21237 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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BdnfP21237 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BdnfP21237 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BdnfP21237 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BdnfP21237 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BdnfP21237 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BdnfP21237 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BdnfP21237 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BdnfP21237 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BdnfP21237 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BdnfP21237 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BdnfP21237 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BdnfP21237 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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BdnfP21237 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BdnfP21237 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BdnfP21237 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BdnfP21237 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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BdnfP21237 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BdnfP21237 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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BdnfP21237 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BdnfP21237 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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BdnfP21237 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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BdnfP21237 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BdnfP21237 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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BdnfP21237 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BdnfP21237 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BdnfP21237 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BdnfP21237 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BdnfP21237 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BdnfP21237 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BdnfP21237 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BdnfP21237 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BdnfP21237 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BdnfP21237 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BdnfP21237 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BdnfP21237 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BdnfP21237 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BdnfP21237 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BdnfP21237 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BdnfP21237 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BdnfP21237 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BdnfP21237 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BdnfP21237 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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