Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Gm15968-201ENSMUST00000119342 1168 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Gm37073-201ENSMUST00000192469 1222 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 CT025642.1-201ENSMUST00000224734 1219 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Rpf2-206ENSMUST00000183309 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 CT009711.2-202ENSMUST00000224538 973 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Gm44146-201ENSMUST00000203508 816 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Milr1-202ENSMUST00000106794 1514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms