Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

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Length 120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PolP10400 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PolP10400 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PolP10400 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PolP10400 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PolP10400 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PolP10400 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PolP10400 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PolP10400 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PolP10400 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PolP10400 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PolP10400 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PolP10400 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PolP10400 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PolP10400 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PolP10400 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PolP10400 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PolP10400 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PolP10400 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PolP10400 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PolP10400 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PolP10400 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PolP10400 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PolP10400 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PolP10400 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PolP10400 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PolP10400 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PolP10400 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PolP10400 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PolP10400 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PolP10400 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PolP10400 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PolP10400 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PolP10400 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PolP10400 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PolP10400 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PolP10400 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PolP10400 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PolP10400 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PolP10400 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PolP10400 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PolP10400 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PolP10400 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PolP10400 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PolP10400 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PolP10400 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PolP10400 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PolP10400 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PolP10400 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PolP10400 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PolP10400 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PolP10400 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PolP10400 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PolP10400 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PolP10400 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PolP10400 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PolP10400 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PolP10400 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PolP10400 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PolP10400 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PolP10400 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PolP10400 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PolP10400 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PolP10400 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PolP10400 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PolP10400 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PolP10400 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PolP10400 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PolP10400 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PolP10400 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PolP10400 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PolP10400 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PolP10400 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PolP10400 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PolP10400 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PolP10400 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PolP10400 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PolP10400 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PolP10400 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PolP10400 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PolP10400 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PolP10400 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PolP10400 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PolP10400 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PolP10400 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PolP10400 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PolP10400 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PolP10400 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PolP10400 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PolP10400 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PolP10400 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PolP10400 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PolP10400 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
PolP10400 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PolP10400 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PolP10400 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PolP10400 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PolP10400 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PolP10400 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PolP10400 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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