Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 AC154616.1-201ENSMUST00000226995 804 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms