Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CatspereP0DP43 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms