Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms