Protein–RNA interactions for Protein: P06795

Abcb1b, Multidrug resistance protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb1bP06795 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcb1bP06795 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcb1bP06795 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcb1bP06795 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcb1bP06795 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcb1bP06795 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcb1bP06795 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcb1bP06795 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcb1bP06795 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcb1bP06795 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcb1bP06795 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcb1bP06795 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcb1bP06795 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcb1bP06795 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcb1bP06795 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcb1bP06795 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcb1bP06795 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcb1bP06795 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcb1bP06795 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcb1bP06795 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcb1bP06795 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcb1bP06795 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcb1bP06795 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcb1bP06795 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcb1bP06795 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcb1bP06795 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcb1bP06795 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcb1bP06795 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcb1bP06795 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcb1bP06795 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcb1bP06795 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcb1bP06795 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcb1bP06795 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcb1bP06795 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcb1bP06795 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcb1bP06795 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcb1bP06795 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcb1bP06795 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcb1bP06795 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcb1bP06795 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcb1bP06795 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcb1bP06795 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcb1bP06795 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcb1bP06795 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcb1bP06795 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcb1bP06795 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcb1bP06795 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcb1bP06795 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcb1bP06795 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcb1bP06795 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcb1bP06795 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcb1bP06795 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcb1bP06795 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcb1bP06795 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcb1bP06795 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcb1bP06795 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcb1bP06795 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcb1bP06795 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcb1bP06795 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcb1bP06795 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcb1bP06795 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcb1bP06795 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcb1bP06795 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcb1bP06795 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcb1bP06795 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcb1bP06795 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcb1bP06795 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcb1bP06795 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcb1bP06795 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcb1bP06795 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcb1bP06795 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Abcb1bP06795 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Abcb1bP06795 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcb1bP06795 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcb1bP06795 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcb1bP06795 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcb1bP06795 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcb1bP06795 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcb1bP06795 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcb1bP06795 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcb1bP06795 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcb1bP06795 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcb1bP06795 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcb1bP06795 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcb1bP06795 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcb1bP06795 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcb1bP06795 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcb1bP06795 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcb1bP06795 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcb1bP06795 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcb1bP06795 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcb1bP06795 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcb1bP06795 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcb1bP06795 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcb1bP06795 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcb1bP06795 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcb1bP06795 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcb1bP06795 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcb1bP06795 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcb1bP06795 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms