Protein–RNA interactions for Protein: P05143

Prp2, Proline-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prp2P05143 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prp2P05143 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prp2P05143 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prp2P05143 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prp2P05143 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prp2P05143 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prp2P05143 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prp2P05143 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prp2P05143 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Prp2P05143 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prp2P05143 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms