Protein–RNA interactions for Protein: O88705

Hcn3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, mousemouse

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Length 779 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn3O88705 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Hcn3O88705 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Hcn3O88705 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Hcn3O88705 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Hcn3O88705 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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Hcn3O88705 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Hcn3O88705 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Hcn3O88705 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Hcn3O88705 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Hcn3O88705 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Hcn3O88705 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Hcn3O88705 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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