Protein–RNA interactions for Protein: O88704

Hcn1, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn1O88704 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hcn1O88704 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hcn1O88704 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hcn1O88704 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hcn1O88704 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hcn1O88704 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hcn1O88704 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hcn1O88704 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hcn1O88704 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hcn1O88704 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hcn1O88704 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hcn1O88704 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hcn1O88704 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hcn1O88704 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hcn1O88704 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hcn1O88704 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hcn1O88704 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hcn1O88704 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hcn1O88704 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hcn1O88704 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hcn1O88704 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.9 ms