Protein–RNA interactions for Protein: O88676

Mmp23, Matrix metalloproteinase-23, mousemouse

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp23O88676 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Mmp23O88676 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Mmp23O88676 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Mmp23O88676 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Mmp23O88676 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Mmp23O88676 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Mmp23O88676 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Mmp23O88676 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Mmp23O88676 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
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