Protein–RNA interactions for Protein: O70456

Sfn, 14-3-3 protein sigma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfnO70456 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SfnO70456 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SfnO70456 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SfnO70456 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SfnO70456 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SfnO70456 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SfnO70456 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SfnO70456 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SfnO70456 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SfnO70456 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SfnO70456 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SfnO70456 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SfnO70456 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SfnO70456 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SfnO70456 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SfnO70456 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SfnO70456 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SfnO70456 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SfnO70456 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SfnO70456 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SfnO70456 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SfnO70456 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SfnO70456 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SfnO70456 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SfnO70456 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SfnO70456 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SfnO70456 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SfnO70456 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SfnO70456 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SfnO70456 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SfnO70456 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SfnO70456 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SfnO70456 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SfnO70456 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SfnO70456 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SfnO70456 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SfnO70456 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SfnO70456 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SfnO70456 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SfnO70456 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SfnO70456 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SfnO70456 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SfnO70456 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SfnO70456 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SfnO70456 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SfnO70456 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SfnO70456 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SfnO70456 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SfnO70456 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SfnO70456 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SfnO70456 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SfnO70456 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SfnO70456 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SfnO70456 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SfnO70456 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SfnO70456 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SfnO70456 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SfnO70456 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SfnO70456 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SfnO70456 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SfnO70456 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SfnO70456 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SfnO70456 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SfnO70456 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SfnO70456 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SfnO70456 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SfnO70456 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SfnO70456 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SfnO70456 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SfnO70456 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SfnO70456 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SfnO70456 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SfnO70456 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SfnO70456 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SfnO70456 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SfnO70456 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SfnO70456 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SfnO70456 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SfnO70456 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SfnO70456 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SfnO70456 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SfnO70456 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SfnO70456 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SfnO70456 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SfnO70456 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SfnO70456 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SfnO70456 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SfnO70456 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SfnO70456 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SfnO70456 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SfnO70456 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SfnO70456 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SfnO70456 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SfnO70456 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SfnO70456 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SfnO70456 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SfnO70456 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SfnO70456 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SfnO70456 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SfnO70456 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms