Protein–RNA interactions for Protein: O54788

Dffb, DNA fragmentation factor subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffbO54788 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
DffbO54788 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
DffbO54788 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
DffbO54788 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
DffbO54788 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffbO54788 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffbO54788 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffbO54788 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffbO54788 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffbO54788 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffbO54788 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffbO54788 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffbO54788 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffbO54788 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffbO54788 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffbO54788 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffbO54788 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffbO54788 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffbO54788 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffbO54788 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffbO54788 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffbO54788 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
DffbO54788 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
DffbO54788 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffbO54788 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
DffbO54788 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffbO54788 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffbO54788 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffbO54788 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffbO54788 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffbO54788 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffbO54788 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffbO54788 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffbO54788 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffbO54788 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffbO54788 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffbO54788 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffbO54788 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffbO54788 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffbO54788 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffbO54788 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffbO54788 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffbO54788 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffbO54788 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffbO54788 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffbO54788 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffbO54788 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffbO54788 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffbO54788 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DffbO54788 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DffbO54788 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DffbO54788 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DffbO54788 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DffbO54788 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DffbO54788 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DffbO54788 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DffbO54788 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DffbO54788 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DffbO54788 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DffbO54788 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DffbO54788 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DffbO54788 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DffbO54788 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DffbO54788 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DffbO54788 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
DffbO54788 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DffbO54788 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DffbO54788 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DffbO54788 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DffbO54788 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DffbO54788 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DffbO54788 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DffbO54788 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DffbO54788 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
DffbO54788 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DffbO54788 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DffbO54788 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DffbO54788 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DffbO54788 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DffbO54788 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DffbO54788 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DffbO54788 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DffbO54788 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DffbO54788 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DffbO54788 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DffbO54788 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DffbO54788 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DffbO54788 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DffbO54788 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DffbO54788 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DffbO54788 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DffbO54788 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DffbO54788 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DffbO54788 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DffbO54788 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DffbO54788 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DffbO54788 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DffbO54788 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DffbO54788 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DffbO54788 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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