Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CrxO54751 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CrxO54751 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CrxO54751 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CrxO54751 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CrxO54751 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CrxO54751 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CrxO54751 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CrxO54751 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CrxO54751 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CrxO54751 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CrxO54751 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CrxO54751 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CrxO54751 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CrxO54751 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CrxO54751 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CrxO54751 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CrxO54751 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CrxO54751 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CrxO54751 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CrxO54751 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CrxO54751 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CrxO54751 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CrxO54751 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CrxO54751 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CrxO54751 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CrxO54751 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CrxO54751 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CrxO54751 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CrxO54751 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CrxO54751 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CrxO54751 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CrxO54751 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CrxO54751 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CrxO54751 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CrxO54751 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CrxO54751 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CrxO54751 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CrxO54751 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
CrxO54751 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CrxO54751 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CrxO54751 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
CrxO54751 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CrxO54751 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CrxO54751 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CrxO54751 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CrxO54751 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CrxO54751 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
CrxO54751 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CrxO54751 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CrxO54751 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CrxO54751 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CrxO54751 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CrxO54751 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CrxO54751 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CrxO54751 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
CrxO54751 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CrxO54751 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CrxO54751 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CrxO54751 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CrxO54751 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CrxO54751 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CrxO54751 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CrxO54751 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CrxO54751 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
CrxO54751 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CrxO54751 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CrxO54751 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CrxO54751 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CrxO54751 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CrxO54751 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
CrxO54751 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CrxO54751 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CrxO54751 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CrxO54751 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CrxO54751 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CrxO54751 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CrxO54751 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CrxO54751 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CrxO54751 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CrxO54751 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CrxO54751 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CrxO54751 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CrxO54751 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CrxO54751 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CrxO54751 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CrxO54751 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CrxO54751 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CrxO54751 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
CrxO54751 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CrxO54751 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CrxO54751 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CrxO54751 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CrxO54751 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CrxO54751 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
CrxO54751 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
CrxO54751 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CrxO54751 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CrxO54751 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CrxO54751 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms