Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
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