Protein–RNA interactions for Protein: O35930

Gp1ba, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1baO35930 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms