Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms