Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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