Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms