Protein–RNA interactions for Protein: O35345

Kpna6, Importin subunit alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna6O35345 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kpna6O35345 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kpna6O35345 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kpna6O35345 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kpna6O35345 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kpna6O35345 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kpna6O35345 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna6O35345 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna6O35345 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna6O35345 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna6O35345 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna6O35345 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna6O35345 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna6O35345 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna6O35345 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna6O35345 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna6O35345 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna6O35345 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna6O35345 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna6O35345 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna6O35345 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna6O35345 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna6O35345 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna6O35345 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna6O35345 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna6O35345 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna6O35345 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna6O35345 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna6O35345 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna6O35345 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna6O35345 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna6O35345 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna6O35345 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna6O35345 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna6O35345 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna6O35345 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna6O35345 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna6O35345 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna6O35345 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna6O35345 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna6O35345 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna6O35345 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna6O35345 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna6O35345 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna6O35345 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna6O35345 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna6O35345 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna6O35345 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna6O35345 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna6O35345 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna6O35345 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna6O35345 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna6O35345 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms