Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms