Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
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Gm21900J3QP38 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Gm21900J3QP38 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Gm21900J3QP38 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Gm21900J3QP38 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Gm21900J3QP38 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Gm21900J3QP38 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Gm21900J3QP38 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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