Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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