Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms