Protein–RNA interactions for Protein: G3UWE6

Vmn1r39, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r39G3UWE6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms