Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC12.15□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC12.15□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC12.15□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC12.15□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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