Protein–RNA interactions for Protein: F8VPN3

Gm5160, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5160F8VPN3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms