Protein–RNA interactions for Protein: F7CQW8

Gm3371, Predicted gene 3371 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3371F7CQW8 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms