Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms