Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SmgcF6VRN1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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