Protein–RNA interactions for Protein: F6TVX7

Gm20671, Predicted gene 20671 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20671F6TVX7 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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