Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gm340F6RGI3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gm340F6RGI3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gm340F6RGI3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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