Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms