Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8F9

6030445D17Rik, RIKEN cDNA 6030445D17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030445D17RikE9Q8F9 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms