Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ccdc171E9Q1U1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms