Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Gm26736-201ENSMUST00000180425 1236 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Zfp780b-203ENSMUST00000205874 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 A630023A22Rik-201ENSMUST00000178958 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Peak1os-201ENSMUST00000181444 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Vmn1r89-206ENSMUST00000227319 985 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 4930593A02Rik-201ENSMUST00000181694 1437 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms