Protein–RNA interactions for Protein: E9PVW1

Zkscan7, Zinc finger with KRAB and SCAN domains 7, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan7E9PVW1 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zkscan7E9PVW1 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms