Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gcn1E9PVA8 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gcn1E9PVA8 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gcn1E9PVA8 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gcn1E9PVA8 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
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Gcn1E9PVA8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Gcn1E9PVA8 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Gcn1E9PVA8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms