Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Syde2E9PUP1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms