Protein–RNA interactions for Protein: E0CYV9

1110002E22Rik, RIKEN cDNA 1110002E22 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1110002E22RikE0CYV9 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1110002E22RikE0CYV9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms